Zakład Teorii Układów Złożonych

Instytut Fizyki im. Mariana Smoluchowskiego
Uniwersytet Jagielloński

English

dr Jeremi Ochab

Kontakt

Instytut Fizyki, II piętro, pok. D-2-10
jeremi.ochab[at]uj.edu.pl
Tel: +48 12 664 4797
Konsultacje: poniedziałki 13-14




Google Scholar
ResearchGate
Academia

ORCID

Tematy prac licencjackich i magisterskich

Neuronauka – neuropsychologia – analityka danych – fizyka statystyczna

N0! Ekstrakcja, modelowanie i analiza sieci synaptycznej muszki owocówki
N2. Korelacje danych neurofizjologicznych, aktigraficznych i behawioralnych u osób poddanych
chronicznemu niedoborowi snu
N3. Klasyfikacja chronotypów ludzkich na podstawie genetyki, aktigrafii i neuroobrazowania
N1. Predykcja błędów człowieka na podstawie sygnału EEG

Text-mining – językoznawstwo - humanistyka cyfrowa

L0! Automatyczne rozpoznawanie mowy na potrzeby wielkoskalowej transkrypcji fonetycznej
L0. Universal speech recognition with differentiable allophone graphs
L1! [explainability] Porównanie metod wyjaśnialności w klasyfikatorach stylu literackiego
L2! [explainability] Porównanie metod wyjaśnialności w klasyfikatorach stylu literackiego
L3. Metody klasyfikacji szeregów czasowych w analizie tekstów
L4. Diachroniczne zanurzenia słów i tworzenie równoległych zanurzeń słów (word embeddings)
L5. Analiza sieci złożonych na potrzeby grupowania tekstów
L2. Klasyfikator autorstwa tekstów oparty na analizie szeregów czasowych

Uczenie maszynowe – analityka danych

D0! Powstawanie komunikacji pomiędzy agentami w uczeniu ze wzmocnieniem (multi-agent reinforcement learning) [programowanie + analiza]
D1! [explainability] Wyjaśnialność klasyfikacji wartościami Shapleya dla cech skorelowanych [teoria + programowanie + analiza]
D2. Physics informed neural networks (PINN) for object tracking in sports
D3. Modele do określania póz w analizie rozgrywek sportowych i tworzeniu treningów opartych na danych
D4. Grafowe modele sieci neuronowych

Zainteresowania badawcze

W ogólności szukam zastosowań metod fizyki statystycznej oraz uczenia maszynowego do analizy danych neurofizjologicznych (EEG, fMRI, aktigrafia, etc.) oraz językowych (styl i autorstwo tekstów literackich; vide projekt computationalstylistics.github.io). Prowadziłem lub prowadzę badania dotyczące: wykrywania modułów w sieciach/grafach złożonych, błądzenia przypadkowego (http://arxiv.org/abs/1004.3667), synchronizacji, modelowania epidemii. Powierzchownie interesuję się również językoznawstwem i tłumaczeniem.

Aktualne CV można znaleźć tutaj.

Informacje ogólne

Jestem absolwentem fizyki teoretycznej UJ (w ramach Międzywydziałowych Studiów Matematyczno-Przyrodniczych UJ), doktorem w Zakładzie Teorii Układów Złożonych, współpracującym z prof. Maciejem A. Nowakiem oraz prof. Dantem R. Chialvo oraz członkiem grupy badawczej Stylistyki obliczeniowej przy Instytucie Języka Polskiego PAN. Byłem kierownikiem grantów finansowanych przez Narodowe Centrum Nauki: Sonata 9 pt. Zastosowanie teorii układów złożonych do wielowymiarowej analizy fluktuacji sygnału EEG mózgu człowieka (nr 2015/17/D/ST2/03492) oraz Preludium 5 pt. Statystyczne podstawy wykrywania modułów w sieciach złożonych (nr 2013/09/N/ST6/01419), pracowałem w grancie Maestro pt. Interdyscyplinarne zastosowania teorii macierzy przypadkowych, a obecnie pracuję w grancie Team-Net pt. "Sztuczne sieci neuronowe biologicznie inspirowane". Moje studia doktoranckie (2009-2013) realizowane były w ramach stypendium Fundacji Nauki Polskiej w programie MPD Jagellonian University International PhD Studies in Physics of Complex Systems, w projekcie Dynamical systems on complex networks (http://www.mpd.if.uj.edu.pl) pod kierunkiem prof. Z. Burdy. Otrzymałem stypendium MNISW za wybitne osiągnięcia na rok 2012/13.

Dydaktyka

Obecne studentki/ci:

• mgr M. Lotka, Metody wnioskowania o korelacjach w sygnałach fMRI, fizyka, WFAIS UJ
• inż. P. Domagała, L0. Universal speech recognition with differentiable allophone graphs, informatyka stos., WFAIS UJ, 2024
• lic. Ł. Dobrzycki, D0. Komunikowanie reprezentacji środowiska przez agentów w uczeniu ze wzmocnieniem, informatyka stos., WFAIS UJ, 2024

Wypromowane dyplomantki i dyplomanci:

• mgr K. Maczuga, Model segmentacji mowy i rozpoznawania głosek do transkrypcji fonetycznej języków nisko zasobnych, informatyka stos., WFAIS UJ, 2023
• mgr Kamil Czerwiński, Ekstrakcja wyjaśnialnych cech w klasyfikacji stylu literackiego, informatyka stos., WFAIS UJ, 2023
• dr M. Kądzioła, Ilościowa analiza tekstów współczesnego polskiego języka mówionego, IJP PAN (promotor główny dr hab. Maciej Eder), 11.01.2023
• mgr M. Gwinner, Characterising text-based time series for text classification (informatyka stos., WFAIS UJ)
• lic. A. Kaus, Głębokie sieci neuronowe w rozpoznawaniu mowy - klasyfikacja stanu emocjonalnego mówców (informatyka stos., WFAIS UJ)
• mgr M. Lotka, Metody wnioskowania o korelacjach w sygnałach fMRI, fizyka, WFAIS UJ, 2022
• dr A. Ceglarek, Wpływ pory dnia na powstawanie fałszywych wspomnień – analiza: behawioralna i nieliniowa fMRI, psychologia WZKS UJ (promotor główny prof. T. Marek), 2022
• mgr M. Lewandowska, Analiza korelacji procesu uczenia wielowarstwowego perceptronu, fizyka WFAIS UJ, 2021
• mgr W. Ozimek, Automatyczne streszczanie tekstów w języku polskim, informatyka stosowana WFAIS UJ, 2020
• lic. M. Lotka, Segmentacja sygnału EEG w celu wykrycia odpowiedzi człowieka, fizyka WFAIS UJ, 2020
• lic. M. Rams, Stabilność modeli AR sygnału EEG, fizyka WFAIS UJ, 2020
• mgr A. Katarzyńska, Identyfikacja artefaktów w sygnale EEG, biofizyka WFAIS UJ, 2017
• mgr A. Porzucek, Badanie jakości sygnału EEG zbieranego przy pomocy aktywnych elektrod, biofizyka WFAIS UJ, 2017

W tym roku prowadzę zajęcia z:

24/25Z - Logika i teoria mnogości WFAIS.IF-A202.0: ćwiczenia

24/25Z - Metody statystyczne WFAIS.IF-XO323.0: ćwiczenia

24/25Z - Wstęp do przetwarzania języka naturalnego WFAIS.IF-XO328.0: laboratorium i wykład

23/24L - Warsztat z analizy sygnałów psychofizjologicznych WFAIS.IF-X218.0: Laboratorium (grupa 1)

Prowadziłem zajęcia dydaktyczne:

• Warsztat z analizy sygnałów psychofizjologicznych (koordynowany przez K. Kutta),
• Metody statystyczne (koordynowane przez R. Skibińskiego),
• Stylometria (w ramach "European Summer University in Digital Humanities" (2016-2022,2024),Digital Humanities Summer Institute).
• Warsztaty sztucznej inteligencji I (z K. Kuttem, S. Bobkiem, G. Nalepą),
• Głębokie sieci neuronowe (in English),
• logiki i teorii mnogości (ćwiczenia, I r. informatyki stosowanej, 1 semestr),
• narzędzi obliczeniowych fizyki (ćwiczenia, I r. fizyki, 1 semestr),
• wstęp do analityki danych (in English; laboratoria, II/III r. informatyki stosowanej, 1 semestr),
• statystyczną teorię pola (ćwiczenia, IV r. fizyki teoretycznej, 1 semestr),
• matematykę dyskretną (ćwiczenia, I/II r. informatyki stosowanej, 1 semestr),
• zającia uzupełniające z matematyki (ćwiczenia, I r. fizyki/biofizyki/..., 1 semestr),
• I pracownię fizyczną (1 semestr).

Publikacje

Prace dyplomowe

• Praca magisterska na anglistyce, na specjalizacji tłumaczeniowej (2014):
  Computational stylistics and authorship attribution: what it measures and why it works [po angielsku],
  Promotor: dr Jan Rybicki
  Instytut Anglistyki, Uniwersytet Jagielloński, Kraków
• Praca doktorska z fizyki (2013):
  Statyczne i dynamiczne własności wybranych procesów stochastycznych na sieciach złożonych [po angielsku],
  Promotor: prof. dr hab. Zdzisław Burda
  Instytut Fizyki im. Mariana Smoluchowskiego, Uniwersytet Jagielloński, Kraków
• Praca magisterska z fizyki (2009):
  Warunki pełnej synchronizacji w uogólnionych modelach Kuramoto,
  Promotor: dr hab. Paweł F. Góra
  Instytut Fizyki im. Mariana Smoluchowskiego, Uniwersytet Jagielloński, Kraków

Tłumaczenia

• Mike Barfield, Jess Bradley, Dzień z życia astronauty, kosmicznej kupy i ziemskiej skorupy, Wydawnictwo Dwie Siostry: Warszawa, 2024.
• Richard P. Feynman, Sześć łatwych kawałków. Podstawy fizyki wyjaśnione przez jej najbłyskotliwszego nauczyciela, Znak literanova, Kraków, 2022.
• Gordon L. Dillow, Kosmiczne zderzenia, asteroidy zabójcy i wyścig w obronie Ziemi, Kraków, 2020. (Fire in the Sky: Cosmic Collisions, Killer Asteroids, and the Race to Defend Earth, Scribner, 2019.)
• Neil deGrasse Tyson, Gregory Mone, Astrofizyka dla młodych zabieganych, Insignis, Kraków, 2019.
• Raman Prinja, Chris Wormell, Planetarium. Muzeum Kosmosu, Wydawnictwo Dwie Siostry: Warszawa, 2019.
• Carlo Rovelli, Tajemnica czasu, Wydawnictwo Feeria: Łódź, 2019.
• Neil deGrasse Tyson, Astrofizyka dla zabieganych, Insignis: Kraków, 2017.
• Helen Czerski, Burza w szklance wody. Fizyka w życiu codziennym, Czarna Owca: Warszawa, 2017.
• Randall Munroe, Tłumacz rzeczy, złożone sprawy w prostych słowach, Czarna Owca: Warszawa, 2016.

Popularyzacja nauki:

1. Radio RDC: "Prosty język", audycja "Pan od przyrody", 08.09.2024.
2. "Co z nami robi nieprzespany tydzień?", Małopolska Noc Naukowców, WFAIS UJ, Kraków, 30.09.2022, 29.09.2023 PREZENTACJA.
3. "Nerwowa i krytyczna - sieć", Naukowe Czwartki, WFAIS UJ, Kraków, 2.12.2021 PREZENTACJA.
4. wyborcza.pl, "Polscy naukowcy donoszą", 02.12.2021: Halszka Ogińska, psycholog, Jeremi Ochab, fizyk: Dowiedliśmy, że nie da się szybko odespać zarwanych nocy.
5. naukawpolsce.pap.pl: Osoby wyspane odpoczywają… spokojniej niż niewyspane.
6. naukawpolsce.pap.pl: Ślady niedoboru snu utrzymują się nawet siedem dni.
7. Poranek Radia TOK FM - Weekend, 2021-09-05.
8. everydayhealth.com: Sleep Debt Hampers Brain Function Up to a Week Later, Study Finds.
9. healthline.com: It Can Take More Than a Week to Recover from Days of Sleep Deprivation.
10. Inne doniesienia prasowe dot. artykułu "Observing changes in human functioning ..."

Prezentacje, plakaty i pliki (stare)

1. J. K. Ochab "Reinventing the Triangles: Rule of Thumb for Assessing Detectability," FENS, Rzeszów, 2015 PLAKAT.
2. J.K. Ochab, "Dynamics of Maximal Entropy Random Walk and Generic Random Walk on Cayley trees," http://demonstrations.wolfram.com, 31 stycznia 2012.
3. J.K. Ochab, "Stationary states of Maximal Entropy Random Walk and Generic Random Walk on Cayley trees," http://demonstrations.wolfram.com, 17 stycznia 2012.
4. J. K. Ochab, Z. Burda, "Maximal-Entropy Random Walk, Centrality Measures and Communities," European Conference on Complex Systems, Brussels, 2012, PLAKAT.
5. J. K. Ochab, Z. Burda, "Dynamics of Maximal Entropy Random Walk: solvable cases," European Conference on Complex Systems, Wiedeń, 2011, PLAKAT.
6. J. Ochab, Z. Burda, W. Janke, H. Nagel, B. Waclaw, "Pair-Factorised Steady State model exhibits condensate''s growth on monolayers," 12th International NTZ-Workshop on New Developments in Computational Physics "CompPhys11", Lipsk, 2011, PREZENTACJA.
7. J.K. Ochab, P.F. Góra, "Epidemic thresholds for a static and dynamic small-world network," Random geometry and applications, NORDITA, Sztokholm, 2010, PREZENTACJA.
8. Rozwój epidemii na dynamicznej sieci małego świata, ANIMACJA (zielone piksele = zdrowi, czerwone = wyleczeni, żółte = zarażeni/zarażający; niebieskie linie = dalekozasięgowe, dynamiczne połączenia, które zwiększają szybkość i zasięg epidemii).